Ce voilier, à ne pas confondre avec l'autre San juan, l'Espagnol, fut le premier navire "occidental" construit au Japon pour servir à emmener la délégation Nippone de Hasekura Rokuemon à Rome en 1617. Il fut ordonné par le Daimyo (seigneur) Date Masamune de Sendai, au nord du Japon, construit par des ouvriers locaux formés à l'occidentale et sur les plans d'un navire Espagnol. L'équipage était d'ailleurs en bonne partie Espagnol. La construction et l'expédition furent approuvées et financées par le gouvernement d'Edo, le Bakufu, résidence du Shogun qui régnait en maître à cette époque sur l'archipel. Le navire fit plusieurs croisières au Mexique et au Philippines avant que la religion chrétienne ne soit persécutée et interdite et que le Japon ne se referme de nouveau aux étrangers. Le San Juan Bautista (Saint jean Baptiste), navire de 500 tonnes, long de 55,35 m hors-tout, large de 11,25 avec un tirant d'eau de 3,80 m, possédait un équipage de 180 marins et officiers et était défendu par 18 canons de gros calibre seulement: Il était la copie d'un navire de commerce, lesquels étaient plutôt ventrus et peu armés. En 1993 la valeur historique de ce navire a justifiée une reconstitution au Japon. C'est une des attractions touristiques majeurs de Sendai.